Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LHX9Q9NQ69 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LHX9Q9NQ69 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms