Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms