Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC3GQ9HC16 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3GQ9HC16 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms