Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COMMD5Q9GZQ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COMMD5Q9GZQ3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COMMD5Q9GZQ3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COMMD5Q9GZQ3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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COMMD5Q9GZQ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COMMD5Q9GZQ3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COMMD5Q9GZQ3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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