Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL4Q9C0H6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms