Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM8Q9BZR9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms