Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM55Q9BYV6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms