Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5DQ9BY66 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5DQ9BY66 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms