Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDAC8Q9BY41 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms