Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms