Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIN3AQ96ST3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms