Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNX1Q96RV3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms