Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNC2Q96PR1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms