Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLHL15Q96M94 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL15Q96M94 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms