Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNBD2Q96M20 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms