Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms