Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTUB2Q96DC9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms