Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GIPC3Q8TF64 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms