Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPTSSBQ8NFR3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms