Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG4DQ86TL0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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