Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms