Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRCQ7RTU9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms