Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00299Q6ZSB3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms