Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OPN5Q6U736 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms