Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms