Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms