Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ETFRF1Q6IPR1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ETFRF1Q6IPR1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms