Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC9A4Q6AI14 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms