Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PRAMEF17Q5VTA0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF17Q5VTA0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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