Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHYHD1Q5SRE7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms