Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPIN4Q56A73 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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