Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms