Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms