Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2CD3Q4AC94 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2CD3Q4AC94 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms