Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EDRF1Q3B7T1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms