Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms