Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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