Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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EXT1Q16394 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EXT1Q16394 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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