Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETFDHQ16134 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms