Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GRIK4Q16099 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GRIK4Q16099 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK4Q16099 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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