Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC85BQ15834 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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