Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA6Q15825 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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