Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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