Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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UBE3CQ15386 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBE3CQ15386 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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