Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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