Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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