Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD6Q15008 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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