Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms