Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms