Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTAN1Q13813 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms